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teaching:mfe:ia [2011/03/08 17:24] stuetzle |
teaching:mfe:ia [2011/03/18 11:46] bersini [Mise au point d’un langage de modélisation de systèmes biologiques inspiré des diagrammes de classe et d'état/transition UML] |
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| to the implementation of this library will be studied. The | to the implementation of this library will be studied. The | ||
| library will also be tested in terms of robustness and performance | library will also be tested in terms of robustness and performance | ||
| - | as compared with the previous existing solutions. | + | as compared with the previous existing solutions coming from other technological platforms (Java, PHP, ...). This memoire will be a follow up of a previous memoire. |
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| Le MFE consistera en un développement orienté objet d'une | Le MFE consistera en un développement orienté objet d'une | ||
| cellule biologique minimale avec son métabolisme chimique interne, un génome | cellule biologique minimale avec son métabolisme chimique interne, un génome | ||
| - | élémentaire et sa membrane. Cette cellule devra être capable | + | élémentaire et sa membrane. L'idée est de réaliser le logiciel minimal capable de simuler un organisme vivant. Cette cellule devra être capable |
| de croître et de spontanément se dupliquer. Il fera suite | de croître et de spontanément se dupliquer. Il fera suite | ||
| - | à un MFE déjà réalisé il y a deux ans. | + | à une succession de MFE déjà réalisés ces dernières années. |
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| ===== Etude de la topologie de réseaux de musiciens de Jazz ===== | ===== Etude de la topologie de réseaux de musiciens de Jazz ===== | ||
| - | De plus en plus de scientifiques sont convaincus qu’une même topologie de réseaux (c'est-à-dire la manière dont les nœuds en sont connectés) se retrouve dans de nombreux réseaux, pourtant extraits de réalités très diverses (Web, Internet, réseaux sociaux, biologiques, épidémiques). Cette topologie leur conférerait des propriétés intéressantes comme une plus grande robustesse ou une communication réduite entre les nœuds. Il est possible de construire un réseau de musiciens de Jazz connectant deux musiciens dès lors qu’ils ont joué sur un même disque. Le MFE consistera en un développement logiciel ayant pour but la réalisation automatique de ces réseaux de musiciens à partir de documentations sur les disques téléchargés automatiquement de sites de vente en ligne. | + | De plus en plus de scientifiques sont convaincus qu’une même topologie de réseaux (c'est-à-dire la manière dont les nœuds en sont connectés) se retrouve dans de nombreux réseaux, pourtant extraits de réalités très diverses (Web, Internet, réseaux sociaux, biologiques, épidémiques). Cette topologie leur conférerait des propriétés intéressantes comme une plus grande robustesse ou une communication réduite entre les nœuds. Il est possible de construire un réseau de musiciens de Jazz connectant deux musiciens dès lors qu’ils ont joué sur un même disque ou participé à un même concert. Le MFE consistera en un développement logiciel ayant pour but la réalisation automatique de ces réseaux de musiciens à partir de documentations sur les disques ou les concerts téléchargés automatiquement de sites de vente en ligne. Le mémorant devra réaliser un logiciel capable d'extraire ces informations sur le Web et ensuite exploitera un ensemble d'outils existant lui permettant d'étudier la topologie du réseau ainsi obtenue. |
| * Contact : [[http://code.ulb.ac.be/iridia.people.php?id=1|Hugues Bersini (IRIDIA)]] | * Contact : [[http://code.ulb.ac.be/iridia.people.php?id=1|Hugues Bersini (IRIDIA)]] | ||
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| ===== Mise au point d’un système automatique de génération de code à partir d’un diagramme d’état-transition ===== | ===== Mise au point d’un système automatique de génération de code à partir d’un diagramme d’état-transition ===== | ||
| - | Le diagramme d’état-transition représente le cycle de vie d’un objet, de sa naissance à sa disparition, en suivant les différents états par lesquels cet objet transite. Il est par exemple très largement mis à l’œuvre dans la modélisation des procédures parlementaires (l’évolution des décrets de loi). C’est le cas dans plusieurs parlements belges avec lesquels IRIDIA collabore. Le MFE étudiera la possibilité d’une génération automatique de code fidèle à ces diagrammes et tout ce qui les compose. | + | Le diagramme d’état-transition représente le cycle de vie d’un objet, de sa naissance à sa disparition, en suivant les différents états par lesquels cet objet transite. Il est par exemple très largement mis à l’œuvre dans la modélisation des procédures parlementaires (l’évolution des décrets de loi). C’est le cas dans plusieurs parlements belges avec lesquels IRIDIA collabore. Le MFE étudiera la possibilité d’une génération automatique de code fidèle à ces diagrammes et tout ce qui les compose. Le code généré respectera le design pattern d'état associant une classe à chaque état possible. Des problèmes tels les états compositionnels ou les transitions s'effectuant simultanément seront étudiés. |
| * Contact : [[http://code.ulb.ac.be/iridia.people.php?id=1|Hugues Bersini (IRIDIA)]] | * Contact : [[http://code.ulb.ac.be/iridia.people.php?id=1|Hugues Bersini (IRIDIA)]] | ||
| ===== Mise au point d’un langage de modélisation de systèmes biologiques inspiré des diagrammes de classe et d'état/transition UML ===== | ===== Mise au point d’un langage de modélisation de systèmes biologiques inspiré des diagrammes de classe et d'état/transition UML ===== | ||
| - | En général, les biologistes par manque de formation recourent très difficilement à la programmation des systèmes qu'ils étudient. Nous souhaitons les assister en mettant à leur disposition un langage qualitatif de modélisation sur base des diagrammes de classe et d'état/transition UML. Ce langage pourrait finalement aboutir à une forme exécutable, par une génération de code Java appropriée et son exécution. Le système sera mis au point en collaboration avec des immunologistes avec lesquels IRIDIA entretient des collaborations suivies depuis très longtemps. | + | En général, les biologistes par manque de formation recourent très difficilement à la programmation des systèmes qu'ils étudient. Nous souhaitons les assister en mettant à leur disposition un langage qualitatif de modélisation sur base des diagrammes de classe et d'état/transition UML. Ce langage pourrait finalement aboutir à une forme exécutable, par une génération de code Java appropriée et son exécution. Le système sera mis au point en collaboration avec des immunologistes internationnaux avec lesquels IRIDIA entretient des collaborations suivies depuis très longtemps. Ainsi l'idée est de créer un langage de simulation de systèmes biologique qualitatif et graphique qui soit bien plus facile d'utilisation pour les biologistes que les langages de programmation actuels. |
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| ===== Swarm robotics using the e-puck platform ===== | ===== Swarm robotics using the e-puck platform ===== | ||